Евгений Попов родился 11 сентября 1978 года во Владивостоке. В 1998 году окончил факультет журналистики Дальневосточного государственного универиситета. Будучи студентом работал на приморском телевидении.
С 2000 года — корреспондент «Вестей». Первая должность в программе — корреспондент во Владивостоке. Затем перебрался в Москву. Работал на Украине собкором телеканала «Россия». Впоследствии стал корреспондентом канала в США, первое время работал совместно с Константином Семиным. Являлся главой Нью-Йоркского бюро «Вестей».
В 2013 году продолжил работу в «Вестях» в качестве политического обозревателя. Работал на Евромайдане, в том числе и в одной группе с Антоном Волошиным, трагически погибшим на Украине в июне 2014 года.
С осени 2013 года, после переформатирования программы «Вести+», Попов стал вести авторскую программу «Вести в 23:00» вместо Василия Журавлева и Оксаны Куваевой. С июля 2014 года он передал место ведущего Максиму Киселёву. Попутно делал репортажи для программы «Специальный корреспондент»
В 2014 году, в перерыве между первой и второй эпохой Андрея Кондрашова, вёл главные вечерние выпуски программы «Вести в 20:00». Во время отпуска эту программу вёл шеф берлинского бюро ВГТРК Михаил Антонов.
С сентября 2014 года ведет обсуждения в студии в рамках телевизионного проекта «Специальный корреспондент» вместо Аркадия Мамонтова. В свою очередь после этого в программу «Вести в 20:00» вернулся Андрей Кондрашов.